O Departamento de Conservação e Restauro do MNAA foi criado em 1977. Atualmente conta com conservadores nas áreas de pintura, escultura, mobiliário, desenho e gravura. É responsável pela preservação da coleções, através da monitorização constante das obras, elabora diagnósticos, estabelece prioridades de conservação preventiva e, sempre que necessário, procede a intervenções de conservação e restauro.